Pakiet: plink1.9 (1.90~b7.7-241022-2 i inne)

Odnośniki dla plink1.9

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego plink1.9:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.cog-genomics.org]

Podobne pakiety:

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink1.9 is a comprehensive update of plink with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Please note: The executable was renamed to plink1.9 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z plink1.9

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libatlas3-base [hppa, sh4]

Pakiet przejściowy
dep: libblas3 [nie hppa, sh4]

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [nie hppa, sh4]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

Pakiet niedostępny
dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

Pakiet niedostępny
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

lub liblapack.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie hppa, sh4]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hppa, sh4]
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: libopenblas0

Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

lub libblis4

BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

Pobieranie plink1.9

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.90~b7.7-241022-2	882,6 KiB	2 166,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.90~b7.7-241022-2	793,1 KiB	1 938,0 KiB	[lista plików]
armel	1.90~b7.7-241022-2	789,2 KiB	2 129,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.90~b7.7-241022-2	773,5 KiB	1 489,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.90~b3b-150117-1+b1	803,7 KiB	2 006,0 KiB	[lista plików]
i386	1.90~b7.7-241022-2	890,2 KiB	2 385,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.90~b3b-150117-1	893,3 KiB	1 716,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.90~b7.7-241022-2	887,7 KiB	2 125,0 KiB	[lista plików]