Pakiet: phast (1.6+dfsg-5)

Odnośniki dla phast

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego phast:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [compgen.cshl.edu]

Podobne pakiety:

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Inne pakiety związane z phast

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3 [sparc64]

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

lub liblapack.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe
dep: libtmglib3 (>= 3.12.0) [sparc64]

test matrix generators of LAPACK - shared version

Pobieranie phast

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2 844,7 KiB	28 714,0 KiB	[lista plików]
amd64	2 984,2 KiB	25 002,0 KiB	[lista plików]
arm64	2 806,5 KiB	25 258,0 KiB	[lista plików]
armel	2 597,4 KiB	23 032,0 KiB	[lista plików]
armhf	2 504,6 KiB	17 268,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2 680,7 KiB	24 839,0 KiB	[lista plików]
i386	3 025,2 KiB	26 522,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3 541,5 KiB	55 315,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2 659,3 KiB	21 640,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2 846,9 KiB	29 000,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3 149,7 KiB	32 749,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3 164,8 KiB	31 213,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2 952,4 KiB	20 553,0 KiB	[lista plików]
s390x	2 826,5 KiB	27 878,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2 570,1 KiB	21 586,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2 792,9 KiB	38 773,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2 971,8 KiB	24 820,0 KiB	[lista plików]