Pakiet: khmer (2.1.2+dfsg-9) [debports]
Odnośniki dla khmer
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [khmer.readthedocs.org]
Podobne pakiety:
Zliczanie k-merów sekwencji DNA w pamięci, filtrowanie i przeglądanie wykresów
khmer to biblioteka i zestaw narzędzi wiersza poleceń do pracy z sekwencją DNA. Jest skierowany przede wszystkim do krótkich odczytów danych sekwencjonowania, takich jak te wytwarzane przez platformę Illumina. khmer przyjmuje podejście skoncentrowane na k-merach do analizy sekwencji, i stąd wywodzi się jego nazwa.
Inne pakiety związane z khmer
|
|
|
|
-
- dep: cython3 (>= 0.26.1)
- Rozszerzenia języka C dla Pythona 3
-
- dep: khmer-common
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libbz2-1.0
- Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: libunwind8
- Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
-
- dep: python3-bz2file
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-screed (>= 1.0)
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
Pobieranie khmer
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
ia64 (port nieoficjalny) | 6 427,6 KiB | 33 935,0 KiB | [lista plików] |