Pakiet: concavity (0.1+dfsg.1-5)

Odnośniki dla concavity

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego concavity:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [compbio.cs.princeton.edu]

Podobne pakiety:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Inne pakiety związane z concavity

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

sug: conservation-code

protein sequence conservation scoring tool
sug: pymol

Molekularny system graficzny

Pobieranie concavity

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	252,5 KiB	1 020,0 KiB	[lista plików]