Pakiet: spaln (2.4.7+dfsg-1) [debports]

Odnośniki dla spaln

Zasoby systemu Debian:

Raporty o błędach

Pobieranie pakietu źródłowego :

Nie znaleziono

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Inne pakiety związane z spaln

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.33)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: spaln-data

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie spaln

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
hppa (port nieoficjalny)	330,7 KiB	799,0 KiB	[lista plików]