Pakiet: python3-pairtools (1.0.3-1) [debports]
Odnośniki dla python3-pairtools
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Inne pakiety związane z python3-pairtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6.1 (>= 2.4)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-bioframe
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy
-
- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-yaml
- YAML parser and emitter for Python3
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
Pobieranie python3-pairtools
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 207,9 KiB | 1 177,0 KiB | [lista plików] |