Pakiet: megadepth (1.2.0-4 i inne) [debports]
Odnośniki dla megadepth
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Inne pakiety związane z megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
Pobieranie megadepth
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| alpha (port nieoficjalny) | 1.2.0-4+b1 | 78,4 KiB | 276,0 KiB | [lista plików] |