Pakiet: sumaclust (1.0.36+ds-4)

Odnośniki dla sumaclust

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego sumaclust:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [metabarcoding.org]

Podobne pakiety:

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Inne pakiety związane z sumaclust

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

Pobieranie sumaclust

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	101,0 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
arm64	100,5 KiB	196,0 KiB	[lista plików]
armhf	100,4 KiB	195,0 KiB	[lista plików]
i386	101,6 KiB	163,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	102,0 KiB	196,0 KiB	[lista plików]
riscv64	100,7 KiB	156,0 KiB	[lista plików]
s390x	101,4 KiB	163,0 KiB	[lista plików]