Pakiet: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

Odnośniki dla biobambam2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego biobambam2:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [gitlab.com]

Podobne pakiety:

Narzędzia do przetwarzania plików wyrównań na wczesnym etapie

Ten pakiet zawiera kilka narzędzi do przetwarzania plików BAM, w tym:

  bamsormadup:       sortowanie równoległe i znakowanie duplikatów;
  bamcollate2:       odczytuje i zapisuje pliki BAM w nowej kolejności,
                     tak aby były wyrównane lub pogrupowane według
                     nazwy zapytania;
  bammarkduplicates: odczytuje i zapisuje pliki BAM z duplikatami
                     wyrównań oznaczonymi za pomocą pola flag BAM;
  bammaskflags:      odczytuje i zapisuje pliki BAM, maskując (usuwając)
                     bity z kolumny flag;
  bamrecompress:     odczytuje i zapisuje pliki BAM ze zdefiniowanym
                     ustawieniem kompresji; narzędzie to obsługuje
                     wiele wątków;
  bamsort:           odczytuje i zapisuje pliki BAM posortowane według
                     współrzędnych lub nazwy zapytania;
  bamtofastq:        odczytuje plik BAM i zapisuje FastQ; dane wyjściowe
                     mogą być zgodne lub niezgodne z nazwą zapytania.

Inne pakiety związane z biobambam2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nie ppc64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

collection of data structures and algorithms for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie biobambam2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	9 203,8 KiB	64 327,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	8 944,3 KiB	76 579,0 KiB	[lista plików]
riscv64	8 815,6 KiB	51 675,0 KiB	[lista plików]