Pakiet: bali-phy (4.0~beta16+dfsg-1 i inne)

Odnośniki dla bali-phy

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bali-phy:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.bali-phy.org]

Podobne pakiety:

Pakiet eksperymentalny

Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Inne pakiety związane z bali-phy

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

C++ containers and algorithms that implement JSON
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

program options library for C++
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

program options library for C++
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

Boost Random Number Library
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

Boost Random Number Library
dep: libc6 (>= 2.34) [armhf]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [nie armhf, ia64]
dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej
dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [nie armhf, ia64]

fast type-safe C++ formatting library -- library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 11) [armhf, ia64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

dep: libstdc++6 (>= 14) [nie armhf, ia64, m68k]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

rec: gnuplot

Interaktywny program do tworzenia wykresów, sterowany z wiersza poleceń
również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

System GNU R do obliczeń statystycznych i prezentacji danych w formie graficznej

sug: figtree

Graficzna przeglądarka drzew filogenetycznych
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Pobieranie bali-phy

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	4.0~beta16+dfsg-1	9 700,1 KiB	52 351,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.0~beta16+dfsg-1	8 619,4 KiB	47 527,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.0~beta2+dfsg-1	5 779,1 KiB	26 400,0 KiB	[lista plików]
i386	4.0~beta16+dfsg-1	9 147,2 KiB	50 652,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	4.0~beta2+dfsg-1	11 619,3 KiB	82 739,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	4.0~beta16+dfsg-1	7 741,1 KiB	44 869,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.0~beta16+dfsg-1	8 687,3 KiB	57 950,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.0~beta16+dfsg-1	9 475,9 KiB	55 642,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.0~beta16+dfsg-1	10 037,2 KiB	41 016,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.0~beta16+dfsg-1	7 449,4 KiB	47 780,0 KiB	[lista plików]