Pakiet: ssake (4.0-2)

Odnośniki dla ssake

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ssake:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.bcgsc.ca]

Podobne pakiety:

Aplikacja genomiczna do łączenia milionów bardzo krótkich sekwencji DNA

SSAKE (Short Sequence Assembly by K-mer search and 3' read Extension) jest aplikacją genomiczną, służącą do agresywnego łączenia milionów krótkich sekwencji nukleotydowych poprzez progresywne wyszukiwanie 3 najbardziej optymalnych podciągów o długości k przy użyciu prefiksowego drzewa DNA. SSAKE został zaprojektowany do wykorzystywania informacji z krótkich odczytów sekwencji poprzez ścisłe grupowanie ich w kontigach, które mogą być użyte do opisywania nowych celów sekwencjonowania.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Zaimplementowane w: Perl, implemented-in::python, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Powłoka, Rola: role::program, scope::utility, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z ssake

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libperl4-corelibs-perl

libraries historically supplied with Perl 4
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

sug: ssake-examples

Dane przykładowe do SSAKE, genomicznego asemblera krótkich odczytów

Pobieranie ssake

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	48,4 KiB	213,0 KiB	[lista plików]