Pakiet: maq (0.7.1-8)

Odnośniki dla maq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego maq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [maq.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, scope::utility, Przeznaczenie: Wymaga dodatkowego znacznika, Analizowanie, use::comparing, use::searching, Obsługa formatu: Wymaga dodatkowego znacznika, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Inne pakiety związane z maq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.27)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, i386]
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie maq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	305,4 KiB	553,0 KiB	[lista plików]
arm64	293,7 KiB	521,0 KiB	[lista plików]
armhf	302,6 KiB	492,0 KiB	[lista plików]
i386	319,8 KiB	609,0 KiB	[lista plików]