Pakiet: fastqtl (2.184+dfsg-6 i inne)

Odnośniki dla fastqtl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego fastqtl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [fastqtl.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z fastqtl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base
dep: libboost-iostreams1.67.0

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.67.0

program options library for C++
dep: libc6 (>= 2.25)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libgsl23 (>= 2.5)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libhts2 (>= 1.0)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: r-mathlib

GNU R standalone mathematics library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Pobieranie fastqtl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.184+dfsg-6+b1	191,2 KiB	657,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.184+dfsg-6+b1	169,4 KiB	609,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.184+dfsg-6+b1	157,4 KiB	424,0 KiB	[lista plików]