wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: clonalframe  ]

Pakiet: clonalframe (1.2-9)

Odnośniki dla clonalframe

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego clonalframe:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data

ClonalFrame identifies the clonal relationships between the members of a sample, while also estimating the chromosomal position of homologous recombination events that have disrupted the clonal inheritance.

ClonalFrame can be applied to any kind of sequence data, from a single fragment of DNA to whole genomes. It is well suited for the analysis of MLST data, where 7 gene fragments have been sequenced, but becomes progressively more powerful as the sequenced regions increase in length and number up to whole genomes. However, it requires the sequences to be aligned. If you have genomic data that is not aligned, it is recommend to use Mauve which produces alignment of whole bacterial genomes in exactly the format required for analysis with ClonalFrame.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C++, Rola: Program

Inne pakiety związane z clonalframe

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie clonalframe

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 48,6 KiB127,0 KiB [lista plików]
arm64 44,0 KiB115,0 KiB [lista plików]
armel 41,9 KiB110,0 KiB [lista plików]
armhf 40,7 KiB82,0 KiB [lista plików]
i386 52,5 KiB126,0 KiB [lista plików]
mips 51,4 KiB145,0 KiB [lista plików]
mips64el 53,0 KiB159,0 KiB [lista plików]
mipsel 52,0 KiB145,0 KiB [lista plików]
ppc64el 52,5 KiB147,0 KiB [lista plików]
s390x 46,1 KiB131,0 KiB [lista plików]