Pakiet: bitseq (0.7.5+dfsg-4)

Odnośniki dla bitseq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bitseq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Inne pakiety związane z bitseq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.23)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bitseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	340,3 KiB	1 879,0 KiB	[lista plików]
arm64	299,8 KiB	1 655,0 KiB	[lista plików]
armhf	285,3 KiB	1 090,0 KiB	[lista plików]
i386	359,3 KiB	1 910,0 KiB	[lista plików]