wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: roary  ]

Pakiet: roary (3.12.0+dfsg-2)

Odnośniki dla roary

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego roary:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

high speed stand alone pan genome pipeline

Roary is a high speed stand alone pan genome pipeline, which takes annotated assemblies in GFF3 format (as produced, for instance, by Prokka) and calculates the pan genome. Using a standard desktop PC, it can analyse datasets with thousands of samples, something which is computationally infeasible with existing methods, without compromising the quality of the results. 128 samples can be analysed in under 1 hour using 1 GB of RAM and a single processor. To perform this analysis using existing methods would take weeks and hundreds of GB of RAM. Roary is not intended for meta-genomics or for comparing extremely diverse sets of genomes.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::perl, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing

Inne pakiety związane z roary

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie roary

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 171,7 KiB659,0 KiB [lista plików]