wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: python-pyfaidx  ]

Pakiet: python3-pyfaidx (0.5.5.2-1)

Odnośniki dla python3-pyfaidx

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego python-pyfaidx:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

Inne pakiety związane z python3-pyfaidx

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie python3-pyfaidx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 24,7 KiB117,0 KiB [lista plików]