Pakiet: spaced (1.2.0-201605+dfsg-2)

Odnośniki dla spaced

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego spaced:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [spaced.gobics.de]

Podobne pakiety:

alignment-free sequence comparison using spaced words

Spaced (Words) is a new approach to alignment-free sequence comparison. While most alignment-free algorithms compare the word-composition of sequences, spaced uses a pattern of care and don't care positions. The occurrence of a spaced word in a sequence is then defined by the characters at the match positions only, while the characters at the don't care positions are ignored. Instead of comparing the frequencies of contiguous words in the input sequences, this new approach compares the frequencies of the spaced words according to the pre-defined pattern. An information-theoretic distance measure is then used to define pairwise distances on the set of input sequences based on their spaced-word frequencies. Systematic test runs on real and simulated sequence sets have shown that, for phylogeny reconstruction, this multiple-spaced-words approach is far superior to the classical alignment-free approach based on contiguous word frequencies.

Inne pakiety związane z spaced

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
dep: libgomp1 (>= 9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie spaced

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	54,8 KiB	153,0 KiB	[lista plików]
arm64	48,6 KiB	133,0 KiB	[lista plików]
armel	48,1 KiB	132,0 KiB	[lista plików]
armhf	47,9 KiB	96,0 KiB	[lista plików]
i386	61,2 KiB	160,0 KiB	[lista plików]
mips64el	54,1 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
mipsel	58,3 KiB	179,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	59,4 KiB	209,0 KiB	[lista plików]
s390x	49,7 KiB	153,0 KiB	[lista plików]