[ buster ]
[ bullseye ]
[ Pakiet źródłowy: r-bioc-bitseq ]
Pakiet: r-bioc-bitseq (1.34.0+dfsg-1)
Odnośniki dla r-bioc-bitseq
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-bitseq:
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg-1.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [bioconductor.org]
Podobne pakiety:
transcript expression inference and analysis for RNA-seq data
The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.
Inne pakiety związane z r-bioc-bitseq
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libcurl4 (>= 7.18.0)
- Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: r-api-4.0
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.12
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.15.5)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.3)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-deseq
- GNU R differential gene expression analysis
-
- sug: r-bioc-edger
- Empirical analysis of digital gene expression data in R
Pobieranie r-bioc-bitseq
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| s390x | 1 065,5 KiB | 6 029,0 KiB | [lista plików] |