Pakiet: pbbamtools (1.6.0+dfsg-2)

Odnośniki dla pbbamtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego pbbam:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [pbbam.readthedocs.org]

Podobne pakiety:

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Inne pakiety związane z pbbamtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.4)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpbbam1.6.0 (= 1.6.0+dfsg-2)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

rec: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie pbbamtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mips64el	86,0 KiB	369,0 KiB	[lista plików]