Pakiet: beagle (5.1-200518+dfsg-1)

Odnośniki dla beagle

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego beagle:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [faculty.washington.edu]

Podobne pakiety:

Wywoływanie genotypu, fazowanie genotypu i imputacja niegenotypowanych markerów

Beagle umożliwia określanie genotypów, określanie faz genotypów, imputację niegenotypowanych markerów oraz wykrywanie segmentów tożsamości na podstawie pochodzenia. Imputacja genotypowa opiera się na fazowanych haplotypach i wykorzystuje model częstotliwości haplotypów Li i Stephensa. Beagle implementuje również udoskonalony algorytm IBD w celu wykrywania segmentów homozygotycznych według pochodzenia (HBD) i identycznych według pochodzenia (IBD).

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::java, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z beagle

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime

lub java11-runtime

pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

sug: beagle-doc

Documentation for Beagle

Pobieranie beagle

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	298,5 KiB	622,0 KiB	[lista plików]