Pakiet: bio-tradis (1.4.5+dfsg2-1)

Odnośniki dla bio-tradis

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bio-tradis:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

analyse the output from TraDIS analyses of genomic sequences

Bio-Tradis contains a set of tools to analyse the output from TraDIS analyses.

The Bio-Tradis analysis pipeline is implemented as an extensible Perl library which can either be used as is, or as a basis for the development of more advanced analysis tools.

Please note: You need to manually install BioConductor Edger which can not be distributed by Debian in recent version since it is using non-distributable code locfit.

Inne pakiety związane z bio-tradis

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: libexception-class-perl

module that allows you to declare real exception classes in Perl
dep: libmoose-perl

modern Perl object system framework
dep: libtext-csv-perl

comma-separated values manipulator (using XS or PurePerl)
dep: libtry-tiny-perl

module providing minimalistic try/catch
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-cran-getopt

GNU R package providing command-line parsing functionality
dep: r-cran-mass

GNU R package of Venables and Ripley's MASS
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
dep: smalt

Sequence Mapping and Alignment Tool
dep: tabix

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu

sug: artemis

Program do przeglądania genomów i tworzenia adnotacji
sug: r-bioc-edger

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Pobieranie bio-tradis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	84,8 KiB	245,0 KiB	[lista plików]