Pakiet: unifrac-tools (1.2-2)

Odnośniki dla unifrac-tools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego unifrac-tools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Inne pakiety związane z unifrac-tools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [nie amd64, armel, armhf]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblapacke (>= 3.11.0)

Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

Biblioteka szybkiego algorytmu kompresji LZ - uruchomieniowa
dep: libssu0

high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libsz2 (>= 1.0.6)

Adaptive Entropy Coding library - SZIP
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie unifrac-tools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 532,0 KiB	7 564,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 341,0 KiB	8 124,0 KiB	[lista plików]
armel	1 408,9 KiB	9 010,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 363,8 KiB	5 944,0 KiB	[lista plików]
i386	1 382,2 KiB	9 538,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 137,1 KiB	8 491,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1 232,2 KiB	9 449,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 340,4 KiB	9 724,0 KiB	[lista plików]