Pakiet: trnascan-se (2.0.10+ds-1) [non-free]

Odnośniki dla trnascan-se

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego trnascan-se:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [lowelab.ucsc.edu]

Podobne pakiety:

detection of transfer RNA genes in genomic sequence

tRNAscan-SE identifies 99-100% of transfer RNA genes in DNA sequence while giving less than one false positive per 15 gigabases. Two previously described tRNA detection programs are used as fast, first-pass prefilters to identify candidate tRNAs, which are then analyzed by a highly selective tRNA covariance model. This work represents a practical application of RNA covariance models, which are general, probabilistic secondary structure profiles based on stochastic context-free grammars. tRNAscan-SE searches at ~ 30 000 bp/s. Additional extensions to tRNAscan-SE detect unusual tRNA homologues such as selenocysteine tRNAs, tRNA-derived repetitive elements and tRNA pseudogenes.

Inne pakiety związane z trnascan-se

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: infernal

Wyrównywanie drugorzędowej struktury RNA
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: trnascan-se-common (= 2.0.10+ds-1)

detection of transfer RNA genes in genomic sequence (common files)

Pobieranie trnascan-se

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	155,8 KiB	742,0 KiB	[lista plików]
i386	154,2 KiB	775,0 KiB	[lista plików]