Pakiet: porechop (0.2.4+dfsg-4)

Odnośniki dla porechop

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego porechop:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [rrwick.github.io]

Podobne pakiety:

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Inne pakiety związane z porechop

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

dep: python3 (>= 3~)

Pobieranie porechop

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	54,3 KiB	234,0 KiB	[lista plików]
arm64	51,7 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
armel	50,0 KiB	225,0 KiB	[lista plików]
armhf	50,3 KiB	225,0 KiB	[lista plików]
i386	54,8 KiB	229,0 KiB	[lista plików]
mips64el	51,9 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
mipsel	51,5 KiB	224,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	56,8 KiB	290,0 KiB	[lista plików]
s390x	52,5 KiB	230,0 KiB	[lista plików]