Pakiet: freebayes (1.3.6-2)

Odnośniki dla freebayes

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego freebayes:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Inne pakiety związane z freebayes

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nie amd64]
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

Pobieranie freebayes

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 441,5 KiB	3 976,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 391,0 KiB	3 903,0 KiB	[lista plików]
armel	1 377,0 KiB	3 903,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 384,4 KiB	3 455,0 KiB	[lista plików]
i386	1 502,8 KiB	4 171,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 435,5 KiB	4 360,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1 453,7 KiB	4 345,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 461,7 KiB	4 288,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 383,8 KiB	4 050,0 KiB	[lista plików]