Pakiet: ampliconnoise (1.29-10 i inne)

Odnośniki dla ampliconnoise

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ampliconnoise:

Opiekunowie:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
Tim Booth (Strona QA)
Andreas Tille (Strona QA)
Pranav Ballaney (Strona QA)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Usuwanie szumu z 454 zsekwencjonowanych amplikonów PCR

AmpliconNoise to pakiet programów do czyszczenia danych sekwencyjnych o wysokiej przepustowości. Składa się z trzech głównych części:

Pyronoise - wykonuje klastrowanie oparte na flowgramie w celu wykrycia

            błędnych odczytów.

SeqNoise - usuwa mutacje punktowe PCR. Perseus - usuwa chimery PCR bez konieczności stosowania zestawu

            sekwencji referencyjnych.

Wcześniej istniał niezależny "Pyronoise", napisany przez tych samych autorów, a ten pakiet zawiera zaktualizowaną wersję. W Qiime występuje również "Denoiser", który jest z nim powiązany, ale odrębny.

Znaczniki: Rola: Program

Inne pakiety związane z ampliconnoise

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

rec: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Pobieranie ampliconnoise

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.29-10+b2	1 085,5 KiB	2 041,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.29-10+b2	1 074,0 KiB	2 401,0 KiB	[lista plików]
armel	1.29-10+b2	1 068,5 KiB	2 388,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.29-10+b2	1 062,3 KiB	2 388,0 KiB	[lista plików]
i386	1.29-10+b2	1 079,4 KiB	2 000,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.29-10+b2	1 075,7 KiB	2 423,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1.29-10+b2	1 075,4 KiB	2 410,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.29-10+b2	1 097,9 KiB	3 105,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.29-10+b2	1 076,4 KiB	2 005,0 KiB	[lista plików]