Pakiet: murasaki (1.68.6-13 i inne)

Odnośniki dla murasaki

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-regex1.74.0-icu72

pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.68.6-13+b3	506,7 KiB	3 163,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.6-13+b3	444,2 KiB	3 339,0 KiB	[lista plików]
armel	1.68.6-13+b3	370,9 KiB	2 813,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.68.6-13+b3	378,1 KiB	2 045,0 KiB	[lista plików]
i386	1.68.6-13+b3	518,1 KiB	3 013,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.6-13+b3	480,3 KiB	4 390,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1.68.6-13+b3	471,9 KiB	3 959,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.6-13+b2	503,7 KiB	4 171,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.6-13+b2	450,2 KiB	3 351,0 KiB	[lista plików]