Pakiet: libseqlib2 (1.2.0+dfsg-9)

Odnośniki dla libseqlib2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego libseqlib:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libseqlib2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.33)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libfml0 (>= 0.1+git20190320.b499514)

library for assembling Illumina short reads in small regions
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)

library for reading and writing JSON for C++
dep: libssw0 (>= 1.1)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie libseqlib2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
armel	127,8 KiB	467,0 KiB	[lista plików]