[ Bron: spoa ]
Pakket: spoa (4.0.7+ds-1 en anderen)
Verwijzigingen voor spoa
Debian bronnen:
Het bronpakket spoa downloaden:
Beheerders:
Externe bronnen:
- Homepage [github.com]
Vergelijkbare pakketten:
SIMD partial order alignment tool
Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).
Andere aan spoa gerelateerde pakketten
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC support bibliotheek
-
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds)
- SIMD partial order alignment library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compressiebibliotheek - programma's