[ ソース: r-bioc-pwalign ]
パッケージ: r-bioc-pwalign (1.2.0-3)
r-bioc-pwalign に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-pwalign ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.dsc]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0.orig.tar.xz]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
Perform pairwise sequence alignments
The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.
その他の r-bioc-pwalign 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [s390x]
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.20
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
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- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework