パッケージ: libjellyfish-2.0-dev (2.3.1-2 など)
libjellyfish-2.0-dev に関するリンク
Debian の資源:
jellyfish ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Shaun Jackman (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Michael R. Crusoe (QA ページ)
- Étienne Mollier (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
count k-mers in DNA sequences (development files of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the development files (static library and header files)
その他の libjellyfish-2.0-dev 関連パッケージ
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- dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.1-2+b1)
- count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
libjellyfish-2.0-dev のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 2.3.1-2+b1 | 134.4 kB | 691.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 2.3.1-2+b1 | 132.7 kB | 694.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 2.3.1-2+b1 | 128.8 kB | 617.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 2.3.1-2+b1 | 128.9 kB | 585.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 2.3.1-2+b1 | 141.7 kB | 632.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 2.3.1-2+b1 | 139.9 kB | 776.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 2.3.1-2+b1 | 140.2 kB | 725.0 kB | [ファイル一覧] |