ソースパッケージ: sga (0.10.15-4)
sga に関するリンク
Debian の資源:
メンテナ:
外部の資源:
以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。
- sga
- de novo genome assembler that uses string graphs
その他の sga 関連パッケージ
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- helper programs for debian/rules
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- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
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- adep:
zlib1g-dev
- 圧縮ライブラリ - 開発キット
- または
libz-dev
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです:
zlib1g-dev
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- adep:
libbamtools-dev
- C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
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- adep:
gawk
- GNU awk - パターン検索 & 処理言語
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- adep:
help2man
- man ページ自動生成プログラム
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- adep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- adep:
python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
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- adep:
python-ruffus
- Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
-
- adep:
python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
