[ ソース: scrappie ]
パッケージ: scrappie (1.4.2-8 など)
basecaller for Nanopore sequencer
The Nanopore is a device for DNA/RNA sequencing that does not require an amplification of the material. The polynucleotides are threaded through a pore and while these pass through, the change in the electrostatic potential allows one to identify ("call") the actual base that resides in the pore. Scrappie goes a step further and also attempts to describe modifications to the nucleic acid.
その他の scrappie 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, loong64 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)
- HDF5 C runtime files - serial version
scrappie のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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alpha (非公式の移植版) | 1.4.2-8 | 17,939.3 kB | 22,329.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 1.4.2-8+b8 | 72,098.4 kB | 88,505.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 1.4.2-8+b8 | 17,916.9 kB | 22,208.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 1.4.2-8+b8 | 17,909.8 kB | 22,051.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 1.4.2-8+b8 | 44,823.5 kB | 55,246.0 kB | [ファイル一覧] |
loong64 (非公式の移植版) | 1.4.2-8+b3 | 18,033.5 kB | 23,503.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 1.4.2-8+b8 | 17,927.2 kB | 22,279.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 1.4.2-8+b7 | 17,992.3 kB | 22,364.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 1.4.2-8+b8 | 17,944.8 kB | 22,268.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 1.4.2-8+b5 | 18,011.6 kB | 23,134.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 1.4.2-8+b8 | 17,981.3 kB | 22,223.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 1.4.2-8+b7 | 17,949.9 kB | 23,028.0 kB | [ファイル一覧] |