パッケージ: anfo (0.98-9) [debports]
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
その他の anfo 関連パッケージ
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- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
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- dep: libc6 (>= 2.27)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libelk0
- Scheme の実装 (Extension Language Kit)
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- コマンドラインパラメータ解析用ライブラリ
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- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4)
- protocol buffers C++ library
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム