[ ソース: mdtraj ]
パッケージ: python3-mdtraj (1.11.0-1 など)
python3-mdtraj に関するリンク
Debian の資源:
mdtraj ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [mdtraj.org]
類似のパッケージ:
Read, write and analyze MD trajectories in Python
Read, write and analyze MD trajectories with only a few lines of Python code.
MDTraj is a Python library that allows users to manipulate molecular dynamics (MD) trajectories. Features include:
* Wide MD format support, including pdb, xtc, trr, dcd, binpos, netcdf, mdcrd, prmtop, and more. * Extremely fast RMSD calculations (4x the speed of the original Theobald QCP). * Extensive analysis functions including those that compute bonds, angles, dihedrals, hydrogen bonds, secondary structure, and NMR observables. * Lightweight, Pythonic API.
MDTraj includes a command-line application, mdconvert-mdtraj, for converting trajectories between formats.
This package installs the library for Python 3, together with the command line utilities mdconvert-mdtraj and mdinspect.
その他の python3-mdtraj 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [i386 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.13) [x32]
- dep: python3 (<< 3.14) [x32 以外]
- dep: python3 (>= 3.12~) [x32]
- dep: python3 (>= 3.13~) [x32 以外]
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- dep: python3-astunparse [x32]
- パッケージは利用できません
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- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [x32]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 2.0.0~) [x32 以外]
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- dep: python3-numpy-abi9 [x32]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-numpy2-abi0 [x32 以外]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
- または python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
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- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
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- dep: python3-pyparsing
- alternative to creating and executing simple grammars - Python 3.x
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- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
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- dep: python3-tables
- Hierarchical database for Python3 based on HDF5
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- rec: python3-gsd
- native file format for HOOMD-blue (Python 3 module)
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- rec: python3-netcdf4
- Python 3 interface to the netCDF4 (network Common Data Form) library
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- sug: python-mdtraj-doc
- Read, write and analyze MD trajectories in Python (documentation)