[ trixie ]
[ sid ]
パッケージ: libhts3t64 (1.19+ds-1.1 など) [debports]
C library for high-throughput sequencing data formats
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
その他の libhts3t64 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム