パッケージ: freebayes (1.3.6-2 など) [debports]
Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping
FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.
その他の freebayes 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
-
- dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
-
- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
-
- rec: parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel