[ ソース: murasaki ]
パッケージ: murasaki-common (1.68.6-13)
murasaki-common に関するリンク
Debian の資源:
murasaki ソースパッケージをダウンロード:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
類似のパッケージ:
homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package contains all files that are common to the single core murasaki package and the multi core murasaki-mpi package.
その他の murasaki-common 関連パッケージ
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- dep: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11 - または gnuplot5
- パッケージは利用できません
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- dep: imagemagick
- 画像編集プログラム -- バイナリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16
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- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl core perl modules
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- dep: r-cran-rocr
- ROC 曲線の準備と表示をする GNU Rパッケージ
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- rec: libterm-readkey-perl
- perl module for simple terminal control
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- rec: libtext-wrapi18n-perl
- Text::Wrap の国際化された代替品
- または libtext-wrapper-perl
- simple word wrapping routine