パッケージ: clustalx (2.1+lgpl-9) [debports]
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外部の資源:
- ホームページ [www.clustal.org]
類似のパッケージ:
Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)
This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.
The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.
An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.
その他の clustalx 関連パッケージ
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- dep: libatomic1 (>= 4.8)
- __atomic ビルトイン関数を提供するサポートライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgl1
- ベンダー中立な GL ディスパッチライブラリ -- 旧式 GL サポート
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- dep: libqt5core5a (>= 5.7.0)
- Qt 5 コアモジュール
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- dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI モジュール
- または libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
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- dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)
- Qt 5 ウィジェットモジュール
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- dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)
- Qt 5 XML モジュール
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- sug: boxshade
- 多重配列アライメントのプリティプリンティング
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- sug: clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages