パッケージ: gromacs (2023.1-2) [debports]
gromacs に関するリンク
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外部の資源:
- ホームページ [www.gromacs.org]
類似のパッケージ:
Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools
GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.
It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.
This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.
その他の gromacs 関連パッケージ
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- dep: gromacs-data (= 2023.1-2)
- GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
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- dep: libc6.1 (>= 2.36)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgromacs8 (>= 2023.1)
- GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- rec: cpp
- GNU C プリプロセッサ (cpp)
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- rec: mpi-default-bin
- Standard MPI runtime programs (metapackage)
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- sug: pymol
- Molecular Graphics System