パッケージ: density-fitness (1.1.4-2 など)

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類似のパッケージ:

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

その他の density-fitness 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [ia64, x32]

Library files for libcifpp
dep: libcifpp7 (>= 7.0.9) [ia64, x32 以外]

Library files for libcifpp
dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

object oriented library for crystallographic computing
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [ia64, x32]

Library file for libpdb-redo
dep: libpdb-redo3.3 (>= 3.3.0) [ia64, x32 以外]

Library file for libpdb-redo
dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64 以外]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [ia64, x32]

Library file for libzeep
dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [ia64, x32]

圧縮ライブラリ - ランタイム

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [ia64, x32 以外]

density-fitness のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.1.4-2	494.9 kB	5,975.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.1.4-2	503.7 kB	5,922.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1.4-2	491.9 kB	5,909.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.1.4-2	490.4 kB	5,909.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.1.4-2	491.0 kB	5,845.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.1.4-2	499.9 kB	5,900.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.1.4-2	504.4 kB	5,913.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.0.8-4	461.7 kB	5,675.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.1.4-2	495.8 kB	5,909.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.1.4-2	498.1 kB	5,909.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.1.4-2	499.2 kB	5,984.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.1.4-2	498.8 kB	5,974.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.1.4-2	499.3 kB	5,973.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.1.4-2	497.3 kB	5,869.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.1.4-2	497.9 kB	5,913.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.1.4-2	506.8 kB	5,909.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.1.4-2	490.1 kB	6,745.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.0.8-4+b1	477.6 kB	5,843.0 kB	[ファイル一覧]