[ ソース: vt ]
パッケージ: vt (0.57721+ds-3 など)
toolset for short variant discovery in genetic sequence data
vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.
Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.
その他の vt 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)
- 新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: r-base-core
- GNU R core of statistical computation and graphics system