パッケージ: freebayes (1.3.7-1~exp など) [debports]
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping
FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.
その他の freebayes 関連パッケージ
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)
- C++ wrapper to tabix indexer
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- dep: libunwind8
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel