[ ソース: murasaki ]
パッケージ: murasaki (1.68.6-8 など)
murasaki に関するリンク
Debian の資源:
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
類似のパッケージ:
homology detection tool across multiple large genomes
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
その他の murasaki 関連パッケージ
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- dep: libboost-filesystem1.67.0
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.67.0
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)
- regular expression library for C++
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- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcrypto++6
- General purpose cryptographic library - shared library
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)