[ ソース: delly ]
パッケージ: delly (0.8.1-2)
Structural variant discovery by read analysis
Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.
その他の delly 関連パッケージ
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- dep: libboost-date-time1.67.0
- set of date-time libraries based on generic programming concepts
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- dep: libboost-filesystem1.67.0
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.67.0
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-program-options1.67.0
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:4.2)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libhts2 (>= 1.2.1)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3