[ ソース: hmmer2 ]
パッケージ: hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)
hmmer2 に関するリンク
Debian の資源:
hmmer2 ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [hmmer.janelia.org]
類似のパッケージ:
タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル
HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。
入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ (相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。
その他の hmmer2 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libpvm3
- Parallel Virtual Machine - shared libraries
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- dep: libsquid1
- biosquid dynamic library for biological sequence analysis
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- rec: biosquid
- utilities for biological sequence analysis
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- sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)
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- sug: hmmer2-pvm (>= 2.3.2+dfsg-6)
- PVM (Parallel Virtual Machine) をサポートした HMMER プログラム