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パッケージ: gromacs-mpich (2020.6-2)

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Molecular dynamics sim, binaries for MPICH parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the MPICH (v3) interface. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

タグ: ソフトウェア開発: C での開発, ライブラリ, 分野: 生物学, field::chemistry, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::devel-lib, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, 取り扱い対象: パッケージ化されたソフトウェア

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