[ ソース: covtobed ]
パッケージ: covtobed (1.2.0+dfsg-1)
convert the coverage track from a BAM file into a BED file
Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.
その他の covtobed 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: bamtools
- BAM（ゲノムアラインメント）ファイルの操作用ツール
-
- dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
-
- dep: zlib1g
- 圧縮ライブラリ - ランタイム