パッケージ: anfo (0.98-8)

anfo に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [bioinf.eva.mpg.de]

類似のパッケージ:

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

その他の anfo 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libanfo0 (>= 0.98)

Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libelk0

Scheme の実装 (Extension Language Kit)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libpopt0 (>= 1.14)

コマンドラインパラメータ解析用ライブラリ
dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

protocol buffers C++ library
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

anfo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	105.2 kB	395.0 kB	[ファイル一覧]
armel	99.8 kB	345.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	102.0 kB	305.0 kB	[ファイル一覧]
i386	119.6 kB	417.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	109.5 kB	438.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	110.5 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	114.8 kB	619.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	104.0 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]